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La actualización de la tabla en PK y otro campo en MySQL es esporádicamente lenta

Si bien puede haber muchas razones para esto, quiero mencionar cuál fue la causa raíz en mi caso. Era un error de la aplicación en el que cientos de sesiones de la aplicación intentaban actualizar las mismas filas, lo que provocaba una escalada de bloqueos, una contención de mutex y, como resultado, una ejecución lenta. Después de que nuestro equipo de desarrollo corrigió el código, este problema se resolvió al instante. Gracias a todos.