Construyendo una ACL OO genérica usando Doctrine

Uso NestedSet para almacenar la jerarquía de ACL y el caché para acelerar las cosas.

Doctrine ORM para PHP - NestedSet

Aquí hay una publicación que también puede ser útil:

Zend_Acl parte 3:creación y almacenamiento de ACL dinámicas | CodeUtopia - El blog de Jani Hartikainen

(echa un vistazo a las dos partes anteriores también).