Cómo crear una respuesta json

Pruebe mysql_fetch_assoc:

$json = array();
while ($row = mysql_fetch_assoc($result)) {
    $json[$row['uid']] = array(
       'lat' => $row['lat'],
       'lon' => $row['lon'],
       'loc' => $row['loc']
    );
}
echo json_encode($json);

Debería usar MySQLi o PDO_MySQL en lugar de mysql_.