En el lado derecho del = en el set cláusula, hay dos posibilidades para score :EXCLUDED.score y word_relations.score . La primera es una forma de acceder al valor que se está insertando; el último una forma de acceder al valor almacenado en la fila.
Escribiría esto como:
ON CONFLICT (word1_id, word2_id) DO
UPDATE SET score = word_relations.score + EXCLUDED.score
