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HQL:compruebe si una matriz contiene un valor

Para mapear las matrices, necesitará un tipo personalizado. Puede usar el proyecto hibernate-types para esto:https://vladmihalcea.com/how-to-map-java-and-sql-arrays-with-jpa-and-hibernate/

¿Intentó usar e2.col3 = FUNCTION('ANY', e1.col3Arr)? ¿aún? Si eso no funciona, le sugiero que cree una SQLFunction personalizada que representa el SQL que desea, por ejemplo,

public class ArrayAny implements SQLFunction {

    @Override
    public boolean hasArguments() {
        return true;
    }

    @Override
    public boolean hasParenthesesIfNoArguments() {
        return true;
    }

    @Override
    public Type getReturnType(Type firstArgumentType, Mapping mapping) throws QueryException {
        return firstArgumentType;
    }

    @Override
    public String render(Type firstArgumentType, List args, SessionFactoryImplementor factory) throws QueryException {
        return "any(" + args.get(0) + ")";
    }
}

Tendrás que registrar la función dentro del Dialecto.