Configuración de mi máquina- Ubuntu 16.04- MySql 5.7.13- PHP 7.0.8- Apache 2.4.18
Edite el archivo /etc/dbconfig-common/phpmyadmin.conf, cambiando
dbc_dbport=''
a dbc_dbport='0'
Después de editar el archivo y guardarlo, si todavía está en el asistente común de dbconfig, seleccione reintentar; si no ejecuta sudo dpkg-reconfigure phpmyadmin
(elija Sí cuando se le pregunte si desea reinstalar la base de datos para phpmyadmin) y continúe normalmente sin cambiar ningún valor. Si quieres cambiar algún valor hazlo en el archivo que has editado antes.
Cuando la ventana de configuración le pregunte qué desea hacer con el archivo de configuración existente, elija Mantener la versión local actualmente instalada .
En este punto puede verificar las diferencias y solo deben existir aquellas que usted hizo en el archivo.