Prueba esto:si tu colección fuera 'ejemplo'
db.example.update({}, {$unset: {words:1}}, false, true);
Consulte esto:
http://www.mongodb.org/display/DOCS/Updating#Updating-%24unset
ACTUALIZAR :
El enlace anterior ya no cubre '$unset'ing. Asegúrese de agregar {multi: true}
si desea eliminar este campo de todos los documentos de la colección; de lo contrario, solo lo eliminará del primer documento que encuentre que coincida. Consulte esto para obtener documentación actualizada:
https://docs.mongodb.com/manual/reference/operator/update/unset/
Ejemplo:
db.example.update({}, {$unset: {words:1}} , {multi: true});