Eliminar un campo de todos los elementos en una matriz en mongodb

Puedes usar el nuevo positional identifier para actualizar múltiples elementos en la matriz en 3.6.

Algo como

 db.coll.update( {_id:235399}, {$unset: {"casts.crew.$[].withBase":""}} )

$[] elimina todos los withBase propiedad de los crews formación. Actúa como marcador de posición para actualizar todos los elementos de la matriz.

Utilice multi true para afectar a varios documentos.