Puede usar el $ifNull
operador aquí. Parece que el campo no es una matriz o no está presente por el error dado:
{ "$project": {
"people": 1,
"Count": {
"$size": { "$ifNull": [ "$myFieldArray", [] ] }
}
}}
También es posible que desee verificar el $type
en tu $match
en caso de que existan pero no sean una matriz.