Mongo convierte todos los campos numéricos que se almacenan como cadena

Algo como esto debería funcionar desde el shell de mongo:

db.yourCollection.find({}).forEach(function(doc) { 
    if(isNaN(doc.xyz)) { 
        print('found string: ' + doc._id);
        db.yourCollection.update( 
           { _id: doc._id}, 
           { $set : { "xyz" : parseFloat(doc.xyz) } }
        )
    }
})

Recorre cada documento, usa isNaN como sugirió, entonces $sets el valor del parseFloat valor para el documento actual.