Puede usar el controlador MongoDB para Java para almacenar un objeto BSON y luego convertirlo en una String que luego puede envolver con JSONObject .
Por ejemplo, así es como crearé un documento normal:
BasicDBObject obj = new BasicDBObject();
obj.put("name", "Matt");
obj.put("date", new Date());
Luego, para obtener una String representación del objeto, simplemente llame:
String bsonString = obj.toString();
Envuélvelo con un JSONObject y obtenga el atributo de fecha, que debería devolverlo en un formato compatible con BSON.
JSONObject newObject = new JSONObject(bsonString);
System.out.println(newObject.get("date"));
La salida resultante es algo como:
{"$date":"2012-08-10T05:22:53.872Z"}