$y con $match funciona bien.
Tiene errores de sintaxis en su consulta. Prueba esto.
db.test.aggregate([
{
$match: {
$and: [
{type: {$in: ["TOYS"]}},
{type: {$nin: ["BARBIE"]}},
{time: {$lt:ISODate("2013-12-09T00:00:00Z")}}
]
}
}
])
Y para lo que está tratando de hacer, no necesita un $and
.