Tenga en cuenta que get_or_create
ahora está programado para quedar obsoleto, porque sin soporte de transacciones en MongoDB no puede garantizar la atomicidad.
La forma preferida es actualizar con upsert:
Location.objects(user_id=user_id).update_one(set__point=point, upsert=True)
Más información sobre actualizaciones en la documentación de MongoDB.