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Agregación distinta de MongoDB

Puede usar $addToSet con el marco de agregación para contar objetos distintos.

Por ejemplo:

db.collectionName.aggregate([{
    $group: {_id: null, uniqueValues: {$addToSet: "$fieldName"}}
}])

O extendido para obtener sus valores únicos en una lista adecuada en lugar de un subdocumento dentro de un registro _id nulo:

db.collectionName.aggregate([
    { $group: {_id: null, myFieldName: {$addToSet: "$myFieldName"}}},
    { $unwind: "$myFieldName" },
    { $project: { _id: 0 }},
])