puede que no sea la mejor solución. El único contratiempo en la siguiente sugerencia es obtener "3" de $substr:["$name1",1,3 ] dinámicamente. ¿Pero te da un comienzo?
db.toupper.aggregate([{$project:{name:{$concat:[{$toUpper:{$substr:["$name1",0,1]}},{$substr:["$name1",1,**3**]}]}}}])
abajo está el resultado
db.toupper.find()
"_id" : ObjectId("5767ca0badb381a5cc0d19cd"), "name1" : "lean" }
"_id" : ObjectId("5767ca3aadb381a5cc0d19ce"), "name1" : "lean" }
db.toupper.aggregate([{$project:{name:{$concat:[{$toUpper:{$substr:["$name1",0,1]}},{$substr:["$name1",1,3]}]}}}])
"_id" : ObjectId("5767ca0badb381a5cc0d19cd"), "name" : "Lean" }
"_id" : ObjectId("5767ca3aadb381a5cc0d19ce"), "name" : "Lean" }