Has compartido tu instancia de mangosta haciendo algo como esto
var mongoose = require('mongoose');
module.exports.mongoose = mongoose;
var user = require('./lib/user');
Ahora dentro de "lib/user.js"
var mongoose = module.parent.mongoose;
var model = mongoose.model('User', new mongoose.Schema({ ... });
module.exports = model;
Entonces, al hacerlo así, puede requerir "lib/user.js" en otras aplicaciones