La consulta de fecha funciona con _id pero no con el valor de fecha - MongoDB

El scrape_systemTime el campo en su documento es una cadena, no una Date lo que explica por qué su consulta no funciona.

Entonces debe ser que no estás insertando tus documentos como crees, ya que obtendrías cadenas como esta si insertaras ese campo como:

scrape_systemTime: Date()