Logré solucionar esto mapeando mi objeto y ejecutando 2 actualizaciones separadas. El primero elimina el elemento antiguo y el segundo agrega la versión actualizada. Estoy seguro de que hay una mejor manera de hacer esto, sin embargo, esto parece funcionar.
handleFormSubmit(event) {
event.preventDefault();
const { careerHistoryPositions } = this.state;
ProfileCandidate.update({_id: this.state.profileCandidateCollectionId}, { $unset: {
'careerHistoryPositions': {}
}
})
const updatePosition = this.state.careerHistoryPositions.map((position) => {
ProfileCandidate.update({_id: this.state.profileCandidateCollectionId}, { $push: {
'careerHistoryPositions': {
company: position.company,
title: position.title,
uniqueId: position.uniqueId
}
}
})