¿Cómo ejecutar comandos mongoDB sin procesar usando mongoose?

Prueba esto:

YourModel.db.db.admin().command({setParameter: 1, internalQueryExecMaxBlockingSortBytes: <limit in bytes>}, function (err,res)
{
    console.log(res);
});

Actualización:

También puedes hacerlo sin YourModel .

mongoose.connection.db.admin().command({setParameter: 1, internalQueryExecMaxBlockingSortBytes: 268435456}, function (err,result)
{
    console.log(result);
});

Solo asegúrese de hacerlo después de que se haya establecido la conexión.