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Consulta Mongo DB en Java

Usando QueryBuilder, su consulta debería verse así 

DBObject query = QueryBuilder.start().or(
    QueryBuilder.start("key1").in(764).get(),
    QueryBuilder.start("key2").in(keys).get(),
    QueryBuilder.start().and("key3").is(3).and("key4").is(64).get()
 ).get();

Considere usar jongo (una API sobre mongo-java-driver) simplemente puede copiar/pegar consultas desde el shell:

collection.findOne("{$or:[{key1: {$in:[764]}},{key2:{$in:[#]}}, {$and:[{key3:3},{key4:67}]}]}", keys).as(People.class);