Si usa una base de datos por usuario y no hay flujo de datos entre las bases de datos, entonces no hay límite, ya que siempre puede colocar la base de datos de un determinado cliente pesado en su propio servidor.
Si estaba hablando de un clúster fragmentado, nuevamente creo que está bien. Cuantas más bases de datos tenga, más servidores de configuración de memoria utilizarán. Cuando el servidor de configuración supera su máquina, entonces sabe que tiene bastantes bases de datos.
