Filtre la matriz anidada con condiciones basadas en valores de objetos de varios niveles y actualícelos:agregado + actualización de MongoDB

He escrito la consulta de agregación

        db.session.aggregate([
          {
            $unwind:"$Sessions"
          },
          {
            $unwind:"$Sessions.Conversations"
          },
          {
            $unwind:"$Sessions.Conversations.Messages"
          },
          {
            $match:{
              "Sessions.Id" : "Session01",
              "Sessions.Conversations.Messages.Direction":{
                $in:[
                  "inbound", "outbound"
                ]
              },
              "Sessions.Conversations.Messages.Status":{
                $in:[
                  "sent", "delivered" 
                ]
              }
            }
          },
          {
            $group:{
              "_id":"$Sessions.Conversations.Id",
              "Messages":{
                $push:"$Sessions.Conversations.Messages"
              }
            }
          }
        ]).pretty()

Salida

        {
                "_id" : "Conversation02",
                "Messages" : [
                        {
                                "Id" : "Message05",
                                "Status" : "sent",
                                "Direction" : "outbound"
                        }
                ]
        }
        {
                "_id" : "Conversation01",
                "Messages" : [
                        {
                                "Id" : "Message03",
                                "Status" : "delivered",
                                "Direction" : "inbound"
                        },
                        {
                                "Id" : "Message04",
                                "Status" : "sent",
                                "Direction" : "outbound"
                        }
                ]
        }

Ahora para actualizar el documento:

He usado los posicional-filters

        db.session.update(
          {},
          {
            $set:{
              "Sessions.$[session].Conversations.$[].Messages.$[message].Status":"read"
            }
          },
          {
            "arrayFilters": [{"session.Id":"Session01"},{ "message.Id": "Message05" }] 
          }
        )

Esto actualizará el estado como read para "session.Id":"Session01" y "message.Id": "Message05"

Espero que esto te ayudará. :)

ACTUALIZAR

        db.session.update(
          {},
          {
            $set:{
              "Sessions.$[session].Conversations.$[].Messages.$[message].Status":"read"
            }
          },
          {
            "arrayFilters": [
              {
                "session.Id":"Session01"
              },
              { 
                "message.Direction": {
                  $in :[
                    "inbound", 
                    "outbound"
                  ]
                },
                "message.Status": {
                  $in :[
                    "sent", 
                    "delivered"
                  ]
                }
              }
            ] 
          }
        )