multi sum/count on mongodb (suma de género y total de todos los resultados)

Algo así hará el truco:

db.collection.aggregate([
  {$project: {
    male: {$cond: [{$eq: ["$gender", "male"]}, 1, 0]},
    female: {$cond: [{$eq: ["$gender", "female"]}, 1, 0]},
  }},
  {$group: { _id: null, male: {$sum: "$male"},
                        female: {$sum: "$female"},
                        total: {$sum: 1},
  }},
])

Produciendo dado su ejemplo:

{ "_id" : null, "male" : 2, "female" : 3, "total" : 5 }

La idea clave es usar una expresión condicional para asignar el género a 0 o 1. Después de eso, todo lo que necesita es una simple suma sobre cada campo.