Solo haz esto:
$set: {"profile.name": "Test2", "profile.new_fields": "value"}
Es decir. Estabas reemplazando todo el hash. En su lugar, puede actualizar los campos dentro del hash.
Solo haz esto:
$set: {"profile.name": "Test2", "profile.new_fields": "value"}
Es decir. Estabas reemplazando todo el hash. En su lugar, puede actualizar los campos dentro del hash.