Un .dbshell se crea en cualquiera que sea el directorio actual y no hay un único .dbshell global como sería bajo un sistema basado en Unix.
TLDR:
Instalé mongodb en mi VM de Windows por curiosidad por una respuesta y ejecuté algunos comandos mientras estaba en el bin carpeta de la instalación. Vi un .dbshell en el bin carpeta que tenía todos los comandos que usé en ella. Luego fui a c:\temp y dio la ruta completa del mongo shell, y ejecutó algunos comandos allí. Noté un .dbshell creado en c:\temp después de salir, que tenía el historial de los comandos mientras estaba en esa carpeta.