¿Es posible tener una condición en la población de mangostas?

Puede incluir en poblar where condiciones como:

Story
.find(...)
.populate({
  path: 'fans',
  match: { age: { $gte: 21 }},
  select: 'name -_id',
  options: { limit: 5 }
})
.exec()

Aquí está la documentación de Mongoose Populate