Como se especifica en documentos de Mongoose (y en el estándar subyacente para el formato GeoJSON), un objeto de geometría debe contener un "tipo de geometría" con un valor de uno de
El mensaje de error
unknown GeoJSON type: { coordinates: [13.42493130000003, 52.50074619999999 ]
hace referencia a la propiedad de tipo que falta en el objeto. Incluir type
para evitar el error:
{type: "Point", coordinates: [13.42493130000003, 52.50074619999999 ]}