Compruebe este problema , sugiere usar {auto_reconnect:true} para la conexión mongodb.
También puedes intentar seguir
// Connect to mongodb
var connect = function () {
var options = { server: { socketOptions: { keepAlive: 1 } } };
mongoose.connect('mongodb://localhost/db1', options);
};
connect();
mongoose.connection.on('error', console.log);
mongoose.connection.on('disconnected', connect);