MongoCursorTimeoutException para función agregada

Para establecer la opción de tiempo de espera para la función agregada, debe usar command función de instancia de objeto MongoDB. Por ejemplo:

$result = $database->command(
array(
    'aggregate' => $my_collection,
    'pipeline' => array(
        array('$match' => $filter_query),
        array('$group' => array('_id'=>'$email')),
                    array('$skip'=>$offset),
        array('$limit'=>$per_page)
    )
),
array( 'timeout' => $timeout )
);

Para obtener más información, consulte la documentación