Entonces, después de escribir la pregunta anterior, me di cuenta de lo que hice mal con bastante rapidez.
ASEGÚRESE DE QUE GRUNT NO ESTÉ VIGILANDO SU CARPETA DE DATOS
Tenía mi carpeta de datos dentro de la carpeta del servidor creada por el proyecto Yeoman que estaba siendo observado por Grunt pero también bloqueado por Mongod. Moví mi carpeta de datos (estoy seguro de que podría ignorar el directorio de datos en su lugar) y ahora funciona bien.
Espero que esto le ahorre a alguien más los 20 minutos que me tomó resolverlo :)
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