Obtener la diferencia en segundos de dos fechas en JavaScript

Podría usar getTime() en los objetos Date para obtener la diferencia en milisegundos y luego dividir la diferencia entre 1000;

por ejemplo

now = new Date();
current_date = new Date(now.getUTCFullYear(), now.getUTCMonth(), now.getUTCDate(), now.getUTCHours(), now.getUTCMinutes(), now.getUTCSeconds());
end_date = obj.end_date (Mon, 02 Apr 2012 20:16:35 GMT);
var millisDiff = end_date.getTime() -  current_date.getTime();
console.log(millisDiff / 1000);