Resolví el mismo problema anoche, de esta manera:
> db.test.aggregate({$group:{_id:{$gt:["$field", null]}, count:{$sum:1}}})
{ "_id" : true, "count" : 2 }
{ "_id" : false, "count" : 2 }
Consulte http://docs.mongodb.org /manual/reference/bson-types/#bson-types-comparison-order para obtener una explicación completa de cómo funciona.