Filtrar datos usando mongoose populate

Por favor, intente esto:

Como ya he sugerido, puedes usar esto:

Database.find({})
    .populate({ path: 'components', match: { name: /antr/i }, select: 'name -_id' })
    .exec((err, data) => { console.log(err); res.json(data); });

Dado que está viendo matrices vacías, se debe a la consulta de filtro en match que no encuentra documentos apropiados en la colección de componentes w.r.t. ObjectIds en la matriz de componentes del documento de la base de datos, esto es normal. Puede ser que pueda filtrarlos en el código, ya que no está mirando de esa manera. Puede usar $lookup de mongoDB del marco de agregación que es equivalente a .populate() de mangosta.

Database.aggregate(
    [{
        $lookup: {
            from: "components",
            "let": { "ids": "$components" },
            pipeline: [
                { $match: { $expr: { $in: ['$_id', '$$ids'] } } }],
            as: "dbComponentsArray"
        }
    }, { $unwind: '$dbComponentsArray' }, { $match: { 'dbComponentsArray.name': /antr/i } },
    { $group: { _id: '$_id', dbComponentsArray: { $push: '$dbComponentsArray' }, data: { $first: '$$ROOT' } } }, { $addFields: { 'data.dbComponentsArray': '$dbComponentsArray' } },
    { $replaceRoot: { 'newRoot': '$data' } }])

Datos de muestra en colecciones:

componentes:

/* 1 */
{
    "_id" : ObjectId("5d481cd098ba991c0857959f"),
    "name" : "antracito",
    "updatedAt" : ISODate("2019-08-05T12:10:56.777Z"),
    "__v" : 0
}

/* 2 */
{
    "_id" : ObjectId("5d481cd098ba991c0857958f"),
    "name" : "anacito",
    "updatedAt" : ISODate("2019-08-05T12:10:56.777Z"),
    "__v" : 0
}

/* 3 */
{
    "_id" : ObjectId("5d481cd098ba991c0857951f"),
    "name" : "antracito",
    "updatedAt" : ISODate("2019-08-05T12:10:56.777Z"),
    "__v" : 0
}

/* 4 */
{
    "_id" : ObjectId("5d481cd098ba991c0857952f"),
    "name" : "anacito",
    "updatedAt" : ISODate("2019-08-05T12:10:56.777Z"),
    "__v" : 0
}

base de datos:

/* 1 */
{
    "_id" : ObjectId("5d4979d52a17d10a6c8de81b"),
    "components" : [ 
        ObjectId("5d481cd098ba991c0857951f"), 
        ObjectId("5d481cd098ba991c0857952f"), 
        ObjectId("5d481cd098ba991c0857953f"), 
        ObjectId("5d481cd098ba991c0857959f")
    ]
}

Salida:

/* 1 */
{
    "_id" : ObjectId("5d4979d52a17d10a6c8de81b"),
    "components" : [ 
        ObjectId("5d481cd098ba991c0857951f"), 
        ObjectId("5d481cd098ba991c0857952f"), 
        ObjectId("5d481cd098ba991c0857953f"), 
        ObjectId("5d481cd098ba991c0857959f")
    ],
    "dbComponentsArray" : [ 
        {
            "_id" : ObjectId("5d481cd098ba991c0857959f"),
            "name" : "antracito",
            "updatedAt" : ISODate("2019-08-05T12:10:56.777Z"),
            "__v" : 0
        }, 
        {
            "_id" : ObjectId("5d481cd098ba991c0857951f"),
            "name" : "antracito",
            "updatedAt" : ISODate("2019-08-05T12:10:56.777Z"),
            "__v" : 0
        }
    ]
}