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Cuente eventos e inserte cadena literal durante la agregación

puedes hacer esto con una agregación como esta:

db.user.aggregate([
   {
      $match:{
         $and:[
            {
               timestamp:{
                  $gte: ISODate("2016-10-12T00:00:00.000Z")
               }
            },
            {
               timestamp:{
                  $lt: ISODate("2016-10-13T00:00:00.000Z")
               }
            }
         ]
      }
   },
   {
      $group:{
         _id:"$userId",
         timestamp:{
            $first:"$timestamp"
         },
         send_message:{
            $sum:{
               $cond:[
                  {
                     $eq:[
                        "$event_type",
                        "send_message"
                     ]
                  },
                  1,
                  0
               ]
            }
         },
         clicked_cancel:{
            $sum:{
               $cond:[
                  {
                     $eq:[
                        "$event_type",
                        "clicked_cancel"
                     ]
                  },
                  1,
                  0
               ]
            }
         },
         clicked_ok:{
            $sum:{
               $cond:[
                  {
                     $eq:[
                        "$event_type",
                        "clicked_ok"
                     ]
                  },
                  1,
                  0
               ]
            }
         }
      }
   },
   {
      $project:{
         date:{
            $dateToString:{
               format:"%Y-%m-%d",
               date:"$timestamp"
            }
         },
         userId:1,
         clicked_cancel:1,
         send_message:1,
         clicked_ok:1
      }
   }
])

explicación:

mantener solo el documento para un día específico en $match escenario

agrupar documentos por ID de usuario y contar las ocurrencias de cada evento en $group escenario

finalmente formatee el campo de marca de tiempo en yyyy_MM-dd formato en $proyecto escenario

para los datos que proporcionó, esto generará

{
   "_id":"123123123",
   "send_message":0,
   "clicked_cancel":1,
   "clicked_ok":1,
   "date":"2016-10-12"
}