SQL Server 2008 compara dos tablas en la misma base de datos y se cambia la columna de obtención

Puedes hacer esto usando LEFT JOIN :

SELECT  b.Product,
        b.Qty,
        b.Price,
        Result = CASE WHEN a.product IS NULL THEN 'New'
                    ELSE 'Updated: ' + 
                        STUFF(  CASE WHEN a.Qty != b.Qty THEN ',Qty' ELSE '' END + 
                                CASE WHEN a.Price != b.Price THEN ',Price' ELSE '' END,
                            1, 1, '')
                END
FROM    TableB b    
        LEFT JOIN TableA a
            ON a.Product = b.Product
WHERE   a.Product IS NULL
OR      a.Qty != b.Qty
OR      a.Price != b.Price;

Ejemplo en SQL Fiddle