Oracle considera que las cadenas vacías son NULL mientras que SQL Server no lo hace. ¿Cómo se maneja mejor esto?

No veo una solución fácil para esto.

Tal vez pueda almacenar sus valores como uno o más espacios en blanco -> ' ' , que no son NULLS en Oracle, o realiza un seguimiento de este caso especial a través de campos/tablas adicionales y una capa de adaptador.