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Diferencia entre dos fechas en MySQL

SELECT TIMEDIFF('2007-12-31 10:02:00','2007-12-30 12:01:01');
-- result: 22:00:59, the difference in HH:MM:SS format


SELECT TIMESTAMPDIFF(SECOND,'2007-12-30 12:01:01','2007-12-31 10:02:00'); 
-- result: 79259  the difference in seconds

Entonces, puedes usar TIMESTAMPDIFF para su propósito.