El incremento automático no se reinicia en MySQL

MySQL no le permite disminuir el valor AUTO_INCREMENT, como se especifica aquí:http://dev.mysql.com/doc/refman/5.6/en/alter-table.html

Incluso con sus limitaciones, probaría una de las siguientes:

1. Inserte explícitamente sus identidades para sus datos de prueba. MySQL no tiene problemas con esto, a diferencia de otros motores de bases de datos
2. Elimine y vuelva a crear su columna de identidad (o simplemente cámbiela para que no sea una identidad), si las restricciones no están en ella misma.
3. No use una columna de Identidad y use otro método (como un procedimiento o código externo) para controlar su Identidad. Este es realmente un último recurso y generalmente no lo recomendaría...

Nota de OP:Era (1) eso era lo que necesitaba.