El problema es con el adaptador PHP que está utilizando para comunicarse con Mysql. Por lo que puedo ver, está utilizando el adaptador PDO para obtener el resultado de la consulta. Sin embargo, este adaptador no admite fracciones de segundo (AAAA-MM-DD HH:MM:SS.F).
El adaptador PDO admite AAAA-MM-DD HH:MM:SS y formatea automáticamente el valor de las columnas de fecha y hora en este formato.
Este es un error en el propio adaptador PDO. Encuentre el enlace a continuación como referencia:fuerza el formato de los campos de fecha y hora">http://grokbase.com/t/php/php-bugs/11524dvh68/php-bug-bug-54648-new-pdo-fuerza el formato de los campos de fecha y hora
