MySQL solo obtiene ROLLUP general

HAVING puede hacer el truco sin subconsulta:

SELECT `name`, number, COUNT(1) FROM test GROUP BY `name`, number WITH ROLLUP 
HAVING number IS NOT NULL OR `name` IS NULL;

Esto filtra las filas posteriores al resumen excepto el total general:

name    number  COUNT(1)
------  ------  --------
bar          1         1
bar          2         4
bar          3         1
baz          1         1
baz          2         1
foo          1         2
foo          2         1
foo          3         2
(NULL)  (NULL)        13