PDO looping throug e impresión fetchAll

debería ser

while ($row = $query->fetch(PDO::FETCH_ASSOC)) {
  $id = $row['id'];
  $n = $row['n'];
  $k = $row['k'];
}

Si insiste en fetchAll , entonces

$results = $query->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC);
foreach($results as $row) {
   $id = $row['id'];
   $n = $row['n'];
   $k = $row['k'];
}

PDO::FETCH_ASSOC recupera solo los nombres de las columnas y omite el índice numérico.