Bueno, voy a tratar de responder a mi propia pregunta. Esto es lo mejor que se me ocurrió:
Paquete:
$binary = pack("h*", str_replace('-', '', $string));
Desempaquetar
$string = unpack("h*", $binary);
$string = preg_replace("/([0-9a-f]{8})([0-9a-f]{4})([0-9a-f]{4})([0-9a-f]{4})([0-9a-f]{12})/", "$1-$2-$3-$4-$5", $string);
¿Hay algún problema con esto que cualquiera pueda ver?