Puede alternar la cláusula LIMIT agregada por MySQL Workbench a través de la pestaña Editor SQL dentro de las preferencias de la aplicación (menú Editar -> Preferencias...).
Simplemente desmarque la opción "Limitar filas" dentro de la sección Resultados de la consulta como se muestra a continuación.
EDITAR:
En Workbench 6.0, la casilla de verificación "Limitar filas" se encuentra en la pestaña "Consultas SQL" (nueva pestaña del mismo formulario).