mysql> crear prueba de base de datos; ERROR 1006 (HY000):No se puede crear la 'prueba' de la base de datos (errno:2)

Puede ser un problema con el espacio. Sigue esto

1. Verifique los registros .err en /var/lib/mysql

2. si el registro dice algo como "[ERROR] No se puede iniciar el servidor:no se puede crear el archivo PID:no queda espacio en el dispositivo"

3. Compruebe el tamaño de /var mediante df -hk /var

4. si se usa al 100%, entonces debe encontrar los archivos que se están llenando.

5. encontrar archivo grande en /var por

   find /var/ -type f -size +100000k -exec ls -lh {} \; | awk '{ print $9 ": " $5 }'

6. vea qué archivo puede eliminar y luego reinicie el proceso mysql por

7. /etc/init.d/mysql restart

déjame saber si eso funcionó :)