#1221 - Uso incorrecto de ACTUALIZAR y ORDENAR POR

No puede usar ordenar por y limitar en la instrucción de actualización en el caso de varias tablas.

Citando de la documentación de MySQL:

UPDATE user u 
INNER JOIN 
(
    SELECT 
    *,
    (@i := (@i + 1)) AS row_number
    FROM user u 
    CROSS JOIN (SELECT @i := 0) r
    WHERE user_active=1
    ORDER BY user_planets DESC
)AS t
ON u.Primary_key = t.primary_key
SET u.user_rank_planets = t.row_number.

Nota: Reemplace u.Primary_key y t.primary_key por la clave principal de user mesa.

Lea los primeros párrafos http://dev.mysql.com/doc /refman/5.7/en/update.html