El proceso de eliminación de MySQL es que el usuario no tiene suficientes puntos PHP

Primero, mysql_* está en desuso, por lo que debería considerar cambiarlos en algún momento. Una opción es usar:MySQLi

Volviendo a tu pregunta, podrías hacer esto:

$insert = "UPDATE `users` SET `points` = (`points`-5) WHERE `username` = '".$username."' and points > 5";
mysql_query($insert);
if (mysql_affected_rows() > 0)
{
    // other codes

    $insert = "UPDATE `users` SET `lodd` = (`lodd` +1) WHERE `username` = '".$username."'";
    mysql_query($insert); 
}else{
    echo "You don't have enough points";
}