Cómo insertar valores en una tabla con columnas dinámicas Jdbc/Mysql

También puede usar los metadatos de la base de datos para obtener los nombres de las columnas. Esto tiene la ventaja de que ni siquiera necesita conocer los nombres de las columnas, sino que se recuperan dinámicamente en su código.

public static List<String> getColumns(String tableName, String schemaName) throws  SQLException{

    ResultSet rs=null;

    ResultSetMetaData rsmd=null;
    PreparedStatement stmt=null;
    List<String> columnNames =null;
    String qualifiedName = (schemaName!=null&&!schemaName.isEmpty())?(schemaName+"."+tableName):tableName;
    try{
        stmt=conn.prepareStatement("select * from "+qualifiedName+" where 0=1");
        rs=stmt.executeQuery();//you'll get an empty ResultSet but you'll still get the metadata
        rsmd=rs.getMetaData();
        columnNames = new ArrayList<String>(); 
        for(int i=1;i<=rsmd.getColumnCount();i++)
            columnNames.add(rsmd.getColumnLabel(i));    
    }catch(SQLException e){
        throw e;//or log it
    }
    finally{
        if(rs!=null)
            try {
                rs.close();
            } catch (SQLException e) {
                // TODO Auto-generated catch block
                throw e
            }
        if(stmt!=null)
            try {
                stmt.close();
            } catch (SQLException e) {
                // TODO Auto-generated catch block
                throw e
            }
    }
    return columnNames;
}

Una vez que tenga los nombres de las columnas, puede usarlos como lo haría normalmente (List.size(), por supuesto, le daría el número de columnas).

ACTUALIZAR:

//I will assume that your values (data to be inserted) is a List of Object types and that it is already populated



List<Object> data = new ArrayList<>();
    //you will populate this list

    //getting the column names
    List<String> columnNames = getColumns("MyTable", "MyDB");

    String insertColumns = ""; 
    String insertValues = "";

    if(columnNames != null && columnNames.size() > 0){
        insertColumns += columnNames.get(0);
        insertValues += "?";
    }


    for(int i = 1; i < columnNames.size();i++){
      insertColumns += ", " + columnNames.get(i) ;
      insertValues += "?";
    }

    String insertSql = "INSERT INTO MyDB.MyTable (" + insertColumns + ") values(" + insertValues + ")"; 

    try{
    PrepareStatement ps = conn.prepareStatement(insertSql);

    for(Object o : data){
     ps.setObject(o); //you must pass objects of correct type
    }
    ps.execute(); //this inserts your data
    }catch(SQLException sqle){
      //do something with it
    }

Este código asume que usted pasa objetos de tipos correctos al método PreparedStatement.setObject(Object o). También es posible recuperar tipos de columnas usando información de la metadatabase y luego usar esa información para hacer cumplir la verificación de tipos, pero eso haría que su código fuera mucho más complicado