¿Cómo leo un , como
en PHP/MySQL?

Suponiendo que no haya problemas con las comillas de CSV:

$newStr = str_replace( ',', '<br>', $string );

EDITAR:

Después de ver su reversión, veo que realmente desea reemplazar , con un newline carácter como \r , \n o \r\n :

$newStr = str_replace( ',', "\n", $string );