Antes de continuar con las cosas de la base de datos, debe verificar su javascript y html con cuidado:en este momento no veo ninguna input elemento con un name atributo de id por lo que me parece que debería recibir una advertencia de una variable indefinida cuando usa $_POST['id'] . Lo mismo se aplica a $_POST[$qid] .
Aparte de eso, si id se supone que es un número entero, lo convertiría en int y no citarlo:
$insertquestion[] = (int) $_POST['id'] . ",". (int) $_POST[$qid];
Si no se supone que ambos son números enteros, al menos eliminaría el espacio inicial después de las comillas.
