Busqué un poco y encontré una gran respuesta. :)
Use la función de cadena de MySql FIND_IN_SET .
Ejemplo de uso:
SET @csvStr = "val1,val2,val3";
SELECT Col1
FROM Table1
WHERE FIND_IN_SET(Col2, @csvStr) > 0;
Edité la respuesta actual con la "Respuesta nueva" y la "Respuesta anterior" señalando que la nueva respuesta abre su sistema a una vulnerabilidad de inyección SQL.
